虚云和尚无病无疾，圆寂前当晚，住在自己的茅棚中。至半夜时起床，发现房间内有二僧，为照顾虚老，他们自己偷偷溜到虚老茅棚里，二人皆身体蜷缩睡在虚老床头和床尾。

见虚老醒来，床头僧起身，看着虚老和尚。虚老见此云：“你怎么在这里呀？”

床尾僧此时也醒来，站了起来。虚老见此云：“你也在这里？”

之后，虚老让两人回寮休息。

两人离开后，不忍离去与其他赶来的僧人，沙弥等，共有四五人或五六人，围绕在虚老和尚茅棚的窗户上，在缝隙中向里面观看。见虚云老和尚，倒了一杯水喝下，在桌子上写下了几个字，之后卧床而眠。

次日，虚云和尚圆寂！虚云和尚最后写下的内容大意是： 反对我的人，你们不要反对了，我马上就要走了；舍不得我的人，不要舍不得了，我去去就来。

虚云和尚的一生，大部分时间生活在中华民族苦难最深重的时期，也是中国佛教最低迷、僧团社会地位最低下的时期。

在漫长的行脚参方过程中，虚云和尚对当时僧团中的种种不如法现象，都有真切的了解，对中国佛教衰败的原因和未来走向，也作过深刻的反思。他认为，僧团是佛教的核心。僧团素质的好坏直接关系到佛教的前途和命运。

虚云和尚在《教习学生规约》中讲：

自正眼不明，人心陷溺，有蔽于声色货利者，有惑于异学左道者，有误于旁蹊曲径者。举世茫茫，赖有人焉，弘传正法，使觉树凋而复茂，慧日暗而再明。无如末劫，障深慧浅，德薄垢重，求其识因果、明罪福亦已难矣！况明心见性入圣超凡乎？所以剃染虽多，解悟者鲜，因乏明师启迪；即有教者，不过学音声法事以为应世之具，将我佛度世悲心，翻为粥饭工具，不亦深可慨乎！